烟台木箱以木材为主要制造材料，难免在运输储藏中存在腐蚀危险。在发展过程中，积累了很多防腐方法，比如：
从古流传下来的老方法：抹桐油；
防腐塑料薄膜覆盖：在木箱内侧衬一层防潮包装物，可防止外部有害气体进入包装内。运输时，外部用塑料薄膜覆盖。
防腐沥青：用沥清煮，钉成箱子在接缝位置刷胶；
烟台木箱在制造过程中，一套特殊工艺流程，有效避免在运输储藏过程中被腐蚀。